A Uniprime está organizada em um sistema de dois níveis que vinculam a Central e suas Singulares.A Uniprime Central Nacional é uma cooperativa de crédito de 2º grau cujo objetivo é organizar e facilitar os serviços de suas cooperativas singulares (1º grau), para que estas realizem o atendimento direto aos associados.As Singulares são cooperativas que prestam serviços financeiros aos seus associados por meio de atendimento nas agências (PACs) e canais digitais, dentro das respectivas áreas de atuação.Atualmente, por meio da autorização do Banco Central do Brasil, a Uniprime Central Nacional atua como apoio para suas singulares filiadas e com prestação de serviços para cooperativas independentes, através da tecnologia e assessoria com o intuito de levar as melhores soluções, para o benefício dos cooperados.